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10 febbraio, 2020 /

일반적으로, 우리는 특히 그들이 말도 안되는 매개 RNA 붕괴 (NMD)에 대한 구조적으로 후보인 것을 필터링하지 않고, 좋은 정렬 및 표준 인트론으로 모든 관찰 된 성적 증명서를보고한다는 사실을 주셔서 감사합니다 (NMD) [12]. 우리의 추정에 따르면 [7], putative 넌센스 전사체는 인간에 있는 100개 이상의 아미노산의 예측된 단백질을 가진 완전 지원되는 전사체의 대략 13%를 나타냅니다 (101,877의 12,855에는 60 염기 쌍 (bp) 및 표준으로 인트론이 있습니다 경계는 정지 코돈의 적어도 55 bp 다운스트림 거짓말, 반대로 4% 웜 (671 의 15,119 위와 같은 기준을 사용 하 여, 최소 인트론 크기는 30 bp 제외). 이 증가는 포유류에 있는 필수적인 다기능 기계장치로 NMD의 진화를 병행할 수 있습니다 [10-12], 또는 우리의 세포가 벌레 보다는 더 관대한 생활 양식이 있다는 것을 나타낼 수 있습니다. 지난 몇 년 동안, mRNA가 단백질 코딩 능력을 넘어 기능적으로 활성화될 수 있다는 증거가 축적되었다[13]; 인간 전사체는 mRNA를 보호하고, 리보솜또는 특정 변형 또는 처리 효소에 대한 접근성을 조절하고, 노화, 세포에서의 위치, 또는 안정성[10]에 대한 접근성을 조절하기 위해 존재하는 메커니즘과 함께 복잡한 수명을 갖는다. 이러한 모든 복잡성을 이해하려면 관찰된 전사체의 포괄적인 해석되지 않은 카탈로그가 필요하며 젠코드 또는 AceView는 이 목표를 목표로 합니다. 속성 검색은 Alga-PrAS 데이터에 액세스하기 위한 가장 포괄적인 검색 기능입니다. 34종 프로테오미에 대하여 28개의 단백질 성질로부터 의 검색 기능을 제공한다(도 1A). 결과 페이지에서 각 속성에 대한 평균 또는 중앙값값을 포함하는 검색된 데이터의 요약이 요약 통계 표(그림 1B)에 표시됩니다. 그런 다음 사용자가 테이블 왼쪽에 있는 하이퍼링크 항목(예: 종, 분류학 클래스) 중 하나를 클릭하면 선택한 항목에 속한 아이디가 동일한 페이지에 나열됩니다. 열거된 아이디는 각 단백질의 항문 상세 페이지에 연결된다(도 2).

이 검색에서는 Alga-PrAS 데이터 간의 비교 분석을 위한 편리한 기능도 있습니다. 표시 옵션을 설정하여 요약 통계 표는 종, 분류학 분류, 서식지, 단세포 또는 다세포성, 단백질 클러스터 및 KOG별로 정렬될 수 있으며, 이는 공통에 따라 사용자가 생물학적 종을 선택할 수 있음을 의미합니다. 분류 용어 (육상 식물, 녹색 조류, 홍조류, Glaucophyceae, 난미세, 규조류 및 기타 미세 조류), 서식지 (담수, 해양, 육상 및 유비쿼터스), 유기체가 하나 또는 여러 세포로 구성되는지 여부, 종별 또는 OrthoMCL 도구 (단일 종 클러스터, 모든 종 클러스터 및 기타)와 직교 클러스터에 의해 일반적인 단백질 클러스터 (Fischer 외.

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